Apagando células do Jupyter antes de salvar

Às vezes quando você não limpa os outputs das células do seu notebook, o tamanho do arquivo final pode ficar muito maior do que o GitHub aceita e isso pode acabar gerando uma dor de cabeça gigante na hora de tentar resetar o notebook já commitado. Pra lidar com isso, a própria documentação Jupyter mostra uma solução: um script que limpa as células quando você salva o arquivo e derruba o kernel.

# primeiro, encontre a pasta de configuração
$ jupyter --config-dir
# /home/usuario/.jupyter

Depois, vá até lá e crie (ou edite) um arquivo chamado jupyter_notebook_config.py e cole o seguinte código nele:

def scrub_output_pre_save(model, **kwargs):
    """scrub output before saving notebooks"""
    # only run on notebooks
    if model['type'] != 'notebook':
        return
    # only run on nbformat v4
    if model['content']['nbformat'] != 4:
        return

    for cell in model['content']['cells']:
        if cell['cell_type'] != 'code':
            continue
        cell['outputs'] = []
        cell['execution_count'] = None

c.FileContentsManager.pre_save_hook = scrub_output_pre_save

Reinicie o jupyter e boa.